20世纪80年代中期，南京大学即为中国社会史研究领域的重镇，特别是蔡少卿教授为代表的中国秘密社会史，在国内外学术界独树一帜。学衡研究院承接这一学术传统，基于新的学术视野，致力于一种复数、小写的新社会史研究，尝试从下层、边缘、地方、日常的视角出发，去理解秘密结社、民间宗教、民间信仰、慈善组织等历史现象，由此重新认识 “中国社会”及其历史演进。目前已出版的成果主要有《近代中国の革命と秘密結社——中国革命の社会史的研究（1895-1955）》（汲古書院2007年版）、《近代中国の宗教、結社と権力》（汲古書院2012年版）、《作为他者的宗教：近代中国的政治与宗教》（台北博扬文化2016年版）等。
　　相关著作：
　　孙江：《作为他者的宗教：近代中国的政治与宗教》，博扬文化事业出版社，2016年。
　　孙江：《近代中国の宗教、結社と権力》，汲古書院，2012年。
　　李里峰：《革命政党与乡村社会》，江苏人民出版社，2011年。
　　孙江：《近代中国の革命と秘密結社——中国革命の社会史的研究（1895-1955）》，汲古書院，2007年。
　　相关译著：
　　（美）罗威廉 (William T.Rowe)著，李里峰等译：《红雨——一个中国县域七个世纪的暴力史》，中国人民大学出版社，2014年。
　　杰拉德·德兰迪、恩靳·伊辛主编，李霞、李恭忠译：《历史社会学手册》，中国人民大学出版社，2009年。
　　托米·本特森、康文林、李中清等著，李霞、李恭忠译：《压力下的生活：1700－1900年欧洲与亚洲的死亡率和生活水平》，社会科学文献出版社，2007年。
　　（澳）安东篱著，李霞译，李恭忠校：《说扬州：1550-1850年的一座中国城市》，中华书局，2007年。
　　相关论文：
　　李恭忠：《蒙冤叙事与下层抗争：天地会起源传说新论》，2016年。
　　孙江：《战场上的尸体——“一·二八事变”中红卍字会的掩埋尸体活动》，《江海学刊》，2015年。
　　李里峰：Rural Mobilization in the Chinese Communist Revolution，Journal of Modern Chinese History,2015年。
　　李恭忠：《他者的眼光：19世纪西方人的天地会研究发微》，《江苏社会科学》，2015年。
　　李里峰：《暴力是恒久的吗?——解读》，《福建论坛》，2014年。
　　孙江：《救赎宗教的困境——伪满统治下的红卍字会》，《学术月刊》，2013年。
　　孙江：《一九二九年宿迁小刀会暴动与极乐庵庙产纠纷案》，《历史研究》，2012年。
　　李恭忠：《“江湖”:中国文化的另一个视窗——兼论“差序格局”的社会结构内涵》，《学术月刊》，2011年。
　　孙江：《在中国发现宗教——日本关于中国民间信仰结社的研究》，《文史哲》，2010年。
　　李里峰：《从“事件史”到“事件路径”的历史——兼论《历史研究》两组义和团研究论文》，《历史研究》，2009年。
　　李恭忠：《谁之县政——民国后期山西四县财政预算岁出结构的案例分析》，《中国社会历史评论》，2009年。
　　陈蕴茜：《城市空间重构与现代知识体系的生产——以清末民国南京城为中心的考察》，《学术月刊》，2008年。
　　陈蕴茜、齐旭：《近代城市空间重组中的精英文化与大众文化——以江苏南通更俗剧场为中心的考察》，《江苏社会科学》，2008年。
　　孙江：《增上寺的香堂——1933年东北青帮代表团的访日之行》，《南京大学学报》，2007年。
　　陈蕴茜：《殖民主义文化霸权与近代中国风俗变迁——以近代上海公墓为中心的考察》，《江海学刊》，2007年。
　　陈蕴茜：《身体政治：国家权力与民国中山装的流行》，《学术月刊》，2007年。
　　孙江：《教派书写与反教派书写》，《文史哲》，2006年。
　　李恭忠：《客家：社会身份、土客械斗与华南地方军事化》，《清史研究》，2006年。
　　孙江：《话语之旅：关于中国叙述中秘密结社话语的考察》，2005年。
　　李恭忠：《行走在政治与学术之间——中国秘密社会史研究的百年历程及其展望》，《河北学刊》，2005年。
　　相关活动 ：  
　　访谈︱孙江：秘密社会究竟有多少“秘密”？